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农业银行短信扣费失败是可以在手机银行进行缴费的。
如果因系统故障或者账户状态存在问题导致扣费失败，可以打开农业银行手机银行，在“我的”账户管理界面中找到短信通知选项，选择补缴服务并按照提示补缴欠费，也可以通过网上银行、网点柜台等途径进行补缴操作，只要账户余额充足且短信提醒服务尚未被取消，即可通过以上途径进行补缴，如果账户余额不足或短信提醒服务已被取消，建议及时充值或重新开通短信提醒服务后再进行补缴操作。
仅供参考，建议咨询农业银行客服获取准确信息，在操作之前确保手机下载并安装了农业银行手机银行应用，并成功登录账户。